研究生思想政治理论课教研室是承担全校硕士研究生和博士研究生思想政治理论课的教学管理、研究和课程建设的部门，肩负着在研究生教育阶段进一步落实立德树人根本任务的光荣使命。教研室由马克思主义学院各学科教学、科研优秀骨干教师组成，所有教师全部具有教授、副教授职称或博士学位。学校领导高度重视研究生思政课建设，参与了硕博士研究生思政课教学工作。

教研室严格全面落实研究生思政课教学工作基本要求，认真贯彻执行落实中共中央宣传部、教育部《新时代学校思想政治理论课改革创新实施方案》（教材〔2020〕6号）文件精神及相关安排，完善研究生思政课教学体系。教研室目前开设有《新时代中国特色社会主义理论与实践》《马克思主义与社会科学方法论》《自然辩证法概论》等硕士研究生思政课必修课程和选修课程，以及《中国马克思主义与当代》博士研究生思政课程。

教研室加强研究生思政课教学改革创新与课程建设，多年来形成了基于规范性、专题式、特色化的医药院校研究生思政课建设模式，成果近年来曾获广东省学位与研究生教育学会优秀教育成果奖、广东药科大学研究生教育教学成果奖特等奖等奖励。